Hola,
por favor lee esta noticia:
http://cnti.gob.ve/noticias/actualidad/software-libre/5519-como-hacer-un-estudio-de-impacto-ambiental-eia-con-solo-software-libre.html
Para el análisis de datos espaciales y generación de planos
QGIS (www.qgis.org)
Para modelamiento de calidad de aire
OpenFoam (www.openfoam.org).
Para el modelamiento hidrológico
HECHMS (http://www.hec.usace.army.mil/software/hec-hms/)
SWAT (http://swat.tamu.edu)
Para modelar el flujo de aguas subterráneas
MODFLOW (http://water.usgs.gov/ogw/modflow/)
Sds