Hola Galo7,Hace un tiempo use una herramienta llamada Systemback con lubuntu que permitia crear una iso desde una instalacion de ubuntu y derivadas que respeta tus modificaciones, con lo que no deberias de tener problemas para que funcione con trisquel, pero eso si, desconozco la licencia de dicha herramienta y por lo tanto, no se si es software libre.
https://launchpad.net/systemback
