Bem... um programa gráfico especificamente eu não sei, mas por que você não
tenta o seguinte:

cd "Caminho da Pasta onde está o programa"
tar -zcvf Beckup.tar.gz *.extensao (compacta todos os txt)

cp Beckup.tar.gz Particao_do_pendrive

rm Beckup.tar.gz

Acho que é isso!
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