Ojalá no tratar de reinventar la rueda: Instalar la librería http://pymmlib.sourceforge.net/ Descargas el último tarball http://sourceforge.net/projects/pymmlib/files/pymmlib/pymmlib-1.2.0/pymmlib-1.2.0.tar.gz/download Lo instalas de la forma estándar o lo pruebas primero en un virtualenv Hay bastante documentación http://pymmlib.sourceforge.net/doc/api_reference/index.html y ejemplos (Dentro tarball) para buscar un procedimiento similar al que quieres hacer y partir de ahí
Saludos 2014-03-11 8:49 GMT-04:00 Eduard Diaz <eventgra...@gmail.com>: > Parece el típico ejemplo de pánico a la hoja en blanco... antes de una > entrega! > > > Suponiendo que tienes los conocimientos para calcular el momento hidrofóbico > de una proteína y ser capaz de identificar las relaciones... > > Divide el problema en partes y divide cada parte en acciones, e intenta ir > de los abstracto a lo concreto. > > Ahora por lo que veo tienes: > > 1.- abrir un archivo pdb y leerlo > 2.- extraer los datos y almacenar los datos importantes > 3.- tratar los datos para detectar la parte hidrofóbica > 4.- calcular el momento, > 5.- etc.. > > Así que lo primero que haría es ver como se puede abrir un archivo pdb [1] > con python y como parsearlo. > > [1] https://en.wikipedia.org/wiki/Protein_Data_Bank_%28file_format%29 > > Prueba a hacer preguntas mas concretar y quizás podamos ayudarte. > > Saludos > > > _______________________________________________ > Python-es mailing list > Python-es@python.org > https://mail.python.org/mailman/listinfo/python-es > FAQ: http://python-es-faq.wikidot.com/ > _______________________________________________ Python-es mailing list Python-es@python.org https://mail.python.org/mailman/listinfo/python-es FAQ: http://python-es-faq.wikidot.com/
