Thiago,

Confesso que nunca vi alguém apresentar em um artigo uma comparação múltipla
multivariada. Acredito que você pode usar um algoritmo k-means classificar
os centróides em grupos homogeneos e tals, da mesma forma como SkottKnott
faz. De qualquer forma, a comparação de modelos que eu me referi está
representada no código abaixo

da <- data.frame(tr=gl(3,8))
da$y1 <- rnorm(da$tr)
da$y2 <- rnorm(da$tr)
da$tr12vs3 <- as.factor(ifelse(as.numeric(da$tr)<=1,1,2))

m0 <- aov(cbind(y1,y2)~1, da)
m1 <- aov(cbind(y1,y2)~tr12vs3, da)
m2 <- aov(cbind(y1,y2)~tr, da)

anova(m0, m1)
anova(m1, m2)

À disposição.
Walmes.

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Walmes Marques Zeviani
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