Em 1/7/2011 18:55, Benilton Carvalho escreveu:
> 2011/7/1 Cesar Rabak<[email protected]>:
>> Em 1/7/2011 17:01, Benilton Carvalho escreveu:
>>>
>>> 2011/7/1 Cesar Rabak<[email protected]>:
>>>>
>>>> Em 30/6/2011 20:51, Benilton Carvalho escreveu:
>>>>>
>>>>> Para reflexão: se w é uma obs Bivariada com componentes (x1, y1), que
>>>>> critérios usar p determinar se ela é maior / menor / igual q z =
(x2,
>>>>> y2)?
[snipped]
Suponha que W represente o perfil de expressao genica (digamos, em
apenas 200 marcadores simultaneamente; os casos com que trabalho
envolvem alguns milhoes de marcadores simultaneamente com milhares de
pacientes) em pacientes com cancer... e que Z seja o analogo em
pessoas saudaveis.
Se voce quiser avaliar a hipotese de que os pacientes apresentam um
perfil genico (no subconjunto acima) de maior expressao que pessoas
saudaveis, como voce definiria tal ordenacao?
Atualmente, uma 'solucao' eh voce efetuar testes marginais e corrigir
por testes multiplos... Mas, se "soubessemos ordenar nesse dominio",
talvez pudessemos ter testes mais poderosos.
Enfim... so' umas ideias pra quem gosta de refletir.
Benilton,
Você passou a conversa de obs Bivariada para dois vetores de expressão
gênica, que salvo melhor informação, são melhor pensados como seqüências
de um dicionário formadas por um alfabeto de quatro símbolos.
Nesse caso a melhor abordagem seria usar uma ordenação lexicográfica
considerando esses símbolos com alguma "ordem" arbitrária, como por
exemplo as próprias letras que sóem representar genes.
Obviamente, essa ordenação não tenhuma relação com a expressão ou não,
mas mantendo uma analogia com o dicionário, pode-se imaginar uma
transformação entre essas seqüências e o que o nosso conhecimento já é
capaz de reconhecer como "marcadores", por exemplo.
[]s
--
Cesar Rabak
GNU/Linux User 52247.
Get counted: http://counter.li.org/
_______________________________________________
R-br mailing list
[email protected]
https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código
mínimo reproduzível.
