Dear all,
I'm comparing cortical thickness of a group of patients to a group of controls.
I want to regress out the effects of gender, age, disease severity and
disease duration.
For the controls, the last two parameters equals zero.
When running mri_glmfit, i get ERROR: matrix is ill-conditioned or
badly scaled, condno = 1e+08
See the design matrix attached. My contrasts are set as
1 -1 0 0 0 0 0 0 0 0
and
-1 1 0 0 0 0 0 0 0 0
What should I do to improve this?
All the best,
Anders
1.000 0.000 1.000 0.000 43.945 0.000 0.300 0.000 26.275
0.000;
1.000 0.000 0.000 0.000 47.622 0.000 0.100 0.000 21.101
0.000;
1.000 0.000 0.000 0.000 23.072 0.000 8.000 0.000 20.329
0.000;
1.000 0.000 0.000 0.000 51.751 0.000 1.700 0.000 39.874
0.000;
1.000 0.000 0.000 0.000 44.986 0.000 4.000 0.000 32.873
0.000;
1.000 0.000 0.000 0.000 42.067 0.000 1.000 0.000 30.259
0.000;
1.000 0.000 1.000 0.000 42.500 0.000 2.000 0.000 21.533
0.000;
1.000 0.000 0.000 0.000 46.661 0.000 3.000 0.000 34.051
0.000;
1.000 0.000 0.000 0.000 33.123 0.000 1.000 0.000 1.117 0.000;
1.000 0.000 1.000 0.000 26.272 0.000 0.300 0.000 18.015
0.000;
1.000 0.000 1.000 0.000 48.066 0.000 1.000 0.000 10.031
0.000;
1.000 0.000 0.000 0.000 49.251 0.000 8.000 0.000 38.987
0.000;
1.000 0.000 1.000 0.000 20.244 0.000 0.500 0.000 7.313 0.000;
1.000 0.000 0.000 0.000 30.949 0.000 3.000 0.000 23.499
0.000;
1.000 0.000 0.000 0.000 20.810 0.000 3.000 0.000 16.405
0.000;
1.000 0.000 1.000 0.000 53.106 0.000 1.000 0.000 43.307
0.000;
1.000 0.000 0.000 0.000 55.321 0.000 1.000 0.000 39.639
0.000;
1.000 0.000 1.000 0.000 24.583 0.000 2.000 0.000 18.357
0.000;
1.000 0.000 0.000 0.000 51.693 0.000 1.000 0.000 35.409
0.000;
1.000 0.000 0.000 0.000 26.497 0.000 2.000 0.000 11.458
0.000;
1.000 0.000 1.000 0.000 44.079 0.000 1.000 0.000 31.463
0.000;
1.000 0.000 0.000 0.000 33.114 0.000 1.000 0.000 22.461
0.000;
1.000 0.000 0.000 0.000 27.556 0.000 2.000 0.000 6.511 0.000;
1.000 0.000 0.000 0.000 25.730 0.000 8.000 0.000 21.517
0.000;
1.000 0.000 0.000 0.000 22.527 0.000 2.000 0.000 6.557 0.000;
1.000 0.000 1.000 0.000 20.413 0.000 1.000 0.000 4.646 0.000;
1.000 0.000 0.000 0.000 22.951 0.000 2.000 0.000 20.687
0.000;
1.000 0.000 1.000 0.000 41.218 0.000 1.000 0.000 0.726 0.000;
1.000 0.000 0.000 0.000 27.578 0.000 2.000 0.000 18.801
0.000;
1.000 0.000 0.000 0.000 27.389 0.000 2.000 0.000 17.793
0.000;
1.000 0.000 0.000 0.000 48.515 0.000 2.000 0.000 34.916
0.000;
1.000 0.000 0.000 0.000 21.878 0.000 4.000 0.000 11.877
0.000;
1.000 0.000 0.000 0.000 55.023 0.000 1.000 0.000 30.883
0.000;
1.000 0.000 1.000 0.000 30.138 0.000 0.500 0.000 3.376 0.000;
1.000 0.000 0.000 0.000 26.689 0.000 1.000 0.000 24.107
0.000;
1.000 0.000 0.000 0.000 29.906 0.000 1.000 0.000 12.674
0.000;
1.000 0.000 1.000 0.000 22.962 0.000 1.000 0.000 8.851 0.000;
1.000 0.000 0.000 0.000 20.178 0.000 2.000 0.000 6.856 0.000;
1.000 0.000 0.000 0.000 19.762 0.000 1.000 0.000 8.882 0.000;
1.000 0.000 1.000 0.000 22.968 0.000 1.000 0.000 7.932 0.000;
1.000 0.000 1.000 0.000 24.789 0.000 1.000 0.000 10.278
0.000;
1.000 0.000 0.000 0.000 27.190 0.000 1.500 0.000 4.309 0.000;
1.000 0.000 1.000 0.000 21.747 0.000 2.000 0.000 11.351
0.000;
1.000 0.000 0.000 0.000 27.650 0.000 1.000 0.000 11.641
0.000;
1.000 0.000 1.000 0.000 22.333 0.000 1.500 0.000 12.331
0.000;
1.000 0.000 0.000 0.000 29.525 0.000 1.000 0.000 19.499
0.000;
1.000 0.000 1.000 0.000 32.263 0.000 1.000 0.000 12.684
0.000;
1.000 0.000 0.000 0.000 28.906 0.000 7.500 0.000 21.670
0.000;
1.000 0.000 0.000 0.000 24.690 0.000 1.000 0.000 7.852 0.000;
1.000 0.000 0.000 0.000 18.639 0.000 1.000 0.000 3.710 0.000;
1.000 0.000 0.000 0.000 24.419 0.000 0.500 0.000 7.477 0.000;
1.000 0.000 0.000 0.000 53.821 0.000 0.167 0.000 30.582
0.000;
1.000 0.000 0.000 0.000 59.072 0.000 1.000 0.000 30.656
0.000;
1.000 0.000 0.000 0.000 31.844 0.000 0.333 0.000 17.654
0.000;
1.000 0.000 0.000 0.000 48.936 0.000 1.000 0.000 28.668
0.000;
1.000 0.000 1.000 0.000 23.669 0.000 2.000 0.000 10.962
0.000;
1.000 0.000 0.000 0.000 45.273 0.000 1.000 0.000 24.934
0.000;
1.000 0.000 0.000 0.000 22.615 0.000 1.500 0.000 2.998 0.000;
1.000 0.000 0.000 0.000 19.138 0.000 3.500 0.000 9.941 0.000;
1.000 0.000 0.000 0.000 42.114 0.000 1.000 0.000 26.042
0.000;
0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 44.742 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 46.155 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 23.247 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 52.969 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 44.266 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 43.389 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 41.361 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 45.837 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 33.262 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 26.056 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 49.596 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 49.322 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 20.137 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 30.478 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 20.854 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 54.316 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 57.322 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 25.185 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 51.737 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 25.539 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 43.132 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 32.646 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 26.702 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 24.879 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 22.149 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 20.444 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 23.688 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 42.053 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 26.664 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 26.957 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 47.447 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 21.837 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 55.650 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 31.099 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 26.571 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 29.388 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 22.390 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 21.607 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 20.745 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 22.773 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 26.026 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 26.209 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 21.520 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 27.316 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 21.804 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 28.126 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 31.357 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 27.644 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 24.296 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 19.181 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 24.044 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 55.384 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 61.251 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 31.691 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 49.123 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 24.096 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 43.636 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 22.535 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 19.986 0.000 0.000 0.000 0.000;
0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 43.520 0.000 0.000 0.000 0.000;
_______________________________________________
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